Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L3Q99457 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NAP1L3Q99457 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NAP1L3Q99457 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms