Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB7Q99436 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB7Q99436 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB7Q99436 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms