Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSF3RQ99062 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms