Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALPK1Q96QP1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK1Q96QP1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK1Q96QP1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms