Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC114Q96M63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC114Q96M63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms