Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNPC3Q96LT9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNPC3Q96LT9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms