Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKNOX2Q96KN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms