Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHDQ96IW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHDQ96IW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHDQ96IW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms