Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP6Q96FZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP6Q96FZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms