Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYFIP2Q96F07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CYFIP2Q96F07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYFIP2Q96F07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms