Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD3Q96ES6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD3Q96ES6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms