Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD1AQ96CP6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.6 ms