Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF653Q96CK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF653Q96CK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms