Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP4CQ96CF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP4CQ96CF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms