Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35C1Q96A29 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35C1Q96A29 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms