Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL2Q969S2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms