Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS3Q969F9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms