Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A3Q93084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2A3Q93084 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms