Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRF1Q92994 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms