Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC1Q92574 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC1Q92574 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms