Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1Q8WXA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1Q8WXA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1Q8WXA9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms