Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC4Q8WW27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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