Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2Q2Q8WVN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2Q2Q8WVN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms