Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MGARPQ8TDB4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms