Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF548Q8NEK5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF548Q8NEK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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