Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3C3Q8NEB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms