Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHBP1Q8NDI1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHBP1Q8NDI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHBP1Q8NDI1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms