Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms