Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHTF2Q8N3S3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHTF2Q8N3S3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms