Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CA13Q8N1Q1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CA13Q8N1Q1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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CA13Q8N1Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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CA13Q8N1Q1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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CA13Q8N1Q1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CA13Q8N1Q1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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