Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NIM1KQ8IY84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NIM1KQ8IY84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms