Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHERPQ8IWX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHERPQ8IWX8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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