Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms