Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD3Q8IVD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUDCD3Q8IVD9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms