Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATAD2AQ86YP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2AQ86YP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms