Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms