Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP9Q7RTR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP9Q7RTR0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP9Q7RTR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms