Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARCQ7LC44 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARCQ7LC44 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms