Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Y3

TRMT10C, Mitochondrial ribonuclease P protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10CQ7L0Y3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT10CQ7L0Y3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT10CQ7L0Y3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms