Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27LQ71UM5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms