Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMUB2Q71RG4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMUB2Q71RG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms