Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP47Q6ZTR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP47Q6ZTR5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP47Q6ZTR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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