Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms