Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BLOC1S2Q6QNY1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BLOC1S2Q6QNY1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms