Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UFSP1Q6NVU6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UFSP1Q6NVU6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms