Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRNIPQ6NTE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms