Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT80Q6KB66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT80Q6KB66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms