Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPRIN2Q6IMN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPRIN2Q6IMN6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms