Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms