Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A4Q6AI14 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A4Q6AI14 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms